Амур — главная река Дальнего Востока — является пограничной рекой России, часть ее водосборной площади находится на китайской территории. Амур образуется от слияния двух притоков — Шилки и Аргуни. Длина реки от слияния до устья составляет 2850 км, площадь водосбора — 2050 тыс. км2. По водности Амур относится к числу наиболее значительных рек России: средний годовой расход воды в устье равен 12800 м3/с, среднемноголетний объем стока — 403 км2. Река судоходна на всем своем протяжении, большое развитие здесь получили водный транспорт и лесосплав.
В бассейне Амура построено 37 водохранилищ суммарным полным объемом 68676 млн. . м3. Зарегулированы также и отдельные малые реки, на которых создано 29 малых водохранилищ полным объемом от 1 до 10 млн. . м3 (суммарный объем 70,9 млн. . м3) и 5 водохранилищ полным объемом от 100 до 1000 млн. . м3 (суммарный объем 186,2 млн. . м3).
Основная часть водосбора находится под влиянием муссонного климата. Питание реки происходит преимущественно за счет летне-осенних муссонных дождей. Летние паводки становятся причиной частых наводнений, наносящих ущерб населению, проживающему в прибрежной зоне.
Являясь основной водной артерией региона. Амур подвергается мощному антропогенному воздействию. В реку поступает значительное количество недостаточно очищенных сточных вод. Качество поверхностных вод Амурского бассейна варьирует в широких пределах — от «слабо загрязненных» до «грязных» и «чрезвычайно грязных». Основные источники загрязнения – предприятия электротехнической, целлюлознo-бумажной, машиностроительной, горнодобывающей промышленности.
В Амур впадают многочисленные притоки, среди них такие крупные, как Зея, Бурея, Уссури, Аргунь, Шилка.
Длина Зеи составляет 1210 км. В верхнем течении река имеет горный характер, ее долина ограничена высокими склонами. В нижнем течении река выходит на равнину, ее долина расширяется, а русло делится на многочисленные рукава. Зея — река с высокой водностью:
средний годовой расход воды 1800 м3/с. На Зее построена крупная ГЭС и большое водохранилище многолетнего регулирования стока (площадь водного зеркала 2419 км2, полный объем 68,4 км3, полезный — 32,1 км3). Зейскин водохозяйственный комплекс используется для гидроэнергетических целен, защиты от наводнений, улучшения транспортных путей.
Река Бурея имеет длину 716 км и также относится к наиболее водным рекам Дальнего Востока: средний годовой расход воды равен 950 м3/с.
Река Уссури набольшей части своего течения является пограничной рекой (с Китаем). Это самая полноводная река Амурского бассейна: средний годовой расход воды составляет около 2000 м3/с. По качеству большинство притоков Уссури относится к классу «загрязненных» или «слабо загрязненных», некоторые малые реки характеризуется как «грязные» либо «очень грязные».
Шилка — левый приток Амура — имеет длину 555 км и почти на всем своем протяжении течет в долине, стесненной горами. Река относительно маловодна:
средний годовой расход воды около 440 м3/с.
При выпадении интенсивных летних ливней Амур, Зея, Бурея и другие реки бассейна часто выходят из берегов и заполняют поймы. В отдельные годы здесь наблюдаются сильные наводнения.